1890年
京师武备学校：陆军军官、士官学校，后并入帝国陆军大学。
南苑炮兵学校：陆军专业炮兵军官、士官学校，后并入帝国陆军大学。
保定陆军学院：原保定讲武学堂，直隶军区的陆军军官、士官学院。
京师同文学院：原京师同文馆，培养军事外语人才。
陆军医学院：设在京师。
1891年
帝国军事情报学院：设在京师北郊，培养军事情报人员。
马尾海军学院：原马尾水师学堂，海军军官学院。
帝国陆军大学：主校区在京郊丰台，江宁有分校区，陆军军官大学。
帝国海军大学：主校区在天津，大连和上海有分校区，海军军官大学。
帝国狙击学校：设在保定，陆军专业士官学校。
承德骑兵学校：骑兵专业士官、军官学院。
1892年
帝国参谋学院：设在京师南郊，陆海军参谋军官学院，中高级指挥参谋人才的再培训基地。
京师禁卫步兵学校：陆军士官学校，禁卫教导旅驻地。
北洋海军技术学院：设在天津，培养海军技术士官、军官。
济南炮兵学校：陆军专业士官学校。
海军医学院：设在天津。
1893年
帝国军事科技学院：设在京师，总参谋部直辖，培养军事科技人员。
帝国联勤学院：设在江宁，培养后勤士官、军官。
济南陆军学院：华东军区的士官、军官学院。
奉天陆军学院：东北军区的陆军士官、军官学校。
1894年
广州海军学院：海军军官、士官学院。
桂林陆军学院：西南军区的陆军士官、军官学院。
兰州陆军学院：西北军区的士官、军官学院。
武昌陆军学院：原武昌讲武学堂，华南军区的士官、军官学院。