正在穿越迁徙岛的小智一行人，受大木博士的委托来到了迁徙岛另外一侧城市——纽特市的宝可梦山庄附近。
皮卡丘舒服的在小智的肩膀上伸了个懒腰，小智笑道：“很舒服吧，皮卡丘？”
“皮卡皮卡。”皮卡丘赞同的点了点头。
天桐道：“树叶间洒落的和煦阳光风味，以及soft and sweet（轻柔又甜蜜）的微风，这才有疗愈的效果，现在是放松时间！”
艾莉丝道：“很难想象这里竟然是城市的正中心呢！”
纽特市的中心竟然像是片森林一般的地方，这都是很难见到的场景。小智三人继续往前走，看到了建筑物。艾莉丝道：“就是那个了吧！”
宝可梦山庄矗立在城市正中心的位置，充满了科技感。
一个金发的青年早就在门口等候多时了，看到小智三人上前道：“欢迎来到宝可梦山庄，我的名字叫艾利克，我接到了大木博士的联络，正在等着你们呢！这位就是小智博士了吧，很荣幸见到你，今天由我来给大家带路。”
宝可梦山庄还没有对外开放，有一部分还没有完工，小智受大木博士的委托来参观，之后再给联盟写份报告就可以了。
艾利克边带路边介绍道：“在这座宝可梦山庄里，有很多不同的舞台造景，为各种宝可梦都准备好了最适合的环境了！”
其实宝可梦山庄内就是一个大型的森林与山地的组合，有湖水有树木还有从外面引进的太阳光，以及挑高的屋顶，给飞行系的宝可梦们也能尽情飞翔。
艾莉丝询问道：“艾利克先生，我们的宝可梦可以在这里玩吗？”
艾利克道：“当然可以！”
小智三人把身上携带的宝可梦都放了出来，任由它们去玩耍。
艾利克继续带着三人来到了宝可梦山庄的后面的区域，这里是一整片的花海，他介绍道：“在环绕宝可梦山庄的外围区域，种植了来自世界各地的植物，一整年当中，都有各种花朵开放。”
这里种植的鲜花种类不少，女孩子总是很喜欢这些花花草草的，艾莉丝十分享受的在花海中跑跑跳跳的。
艾利克道：“前面还有一座迷宫哦！”
小智道：“有意思！”小智感受到迷宫的另一边有宝可梦的波导，这只宝可梦很是强大。
艾利克道：“我接下来还有工作，就一会儿再见了！”
天桐道：“谢谢你的带路！”
小智道：“我找到罕见的宝可梦了，我们进迷宫。”天桐和艾莉丝疑惑的跟了上去，说是迷宫其实也没有太复杂，顺着路就走到了迷宫的后面。
穿越迷宫后，三人看到的就是一片池塘，池塘中正盛开着许多像是睡莲一样的花，什么颜色都有。一只紫红色的宝可梦望着池塘正出神，皮卡丘指着它叫了一声，似乎就吓到它了，变成了一个飞碟的样子。
盖诺赛克特？！
之前N走前跟小智说过，盖诺赛克特是等离子团复活的宝可梦，经过他们改装后，拥有了虫和钢的属性，属于人造的宝可梦，实力堪比神兽级。等离子团当时一共改造了五只，想要控制它们但却被它们破坏了研究所逃走。
现在众人眼前的这一只应该就是那五只之一。
小智抚摸盖诺赛克特道：“你不用害怕的，我们都不是坏人。”
盖诺赛克特被小智释放的常磐之力安抚了，放松下来后，主动邀请皮卡丘和牙牙两只上了自已的背。
“皮卡！”
“牙牙！”
盖诺赛克特像是冲浪板一样的带着皮卡丘和牙牙在池塘上空滑行了起来。它随后也邀请了小智三人都乘坐一次盖诺赛克特牌的冲浪板。玩耍了一阵后，天桐给盖诺赛克特准备了宝可梦食物，它也乖巧的变为原型坐在皮卡丘它们吃着。
艾莉丝问道：“老师，这应该就是之前N先生说过的盖诺赛克特其中的一只了吧！”
小智道：“盖诺赛克特如今的世界上也只有这五只。”小智询问道：“你的同伴们呢？你怎么会在这里的？”
盖诺赛克特吃宝可梦食物的动作一顿，低头看着池塘中的花，道：“我想回去！我想要回家！”
天桐和艾莉丝听到盖诺赛克特说话都短暂吃惊了一瞬，这只居然会心电感应。但它似乎也掌握不久，没有办法表达更多的意思。复活在这个陌生的时代，肯定是会惊慌失措的，没有破坏就已经说明盖诺赛克特的情况已经够好了，只是感受到了不安。
小智道：“虽然我没有办法让你回到你生活的时代，可是我能帮你和你的同伴们找一个适合生活的地方。”
这时另外两只盖诺赛克特降落在小智他们的面前，其中一只还是红色闪光的。看到小智身边的盖诺赛克特低着头一副失落的表情理所当然的认为是小智欺负了它，不由分说就使用了信号光束！
“皮卡！”皮卡丘扬起铁尾直接将信号光束一分为二。
盖诺赛克特挡在了小智他们的面前，红色的盖诺赛克特道：“你在做什么！把敌人全部都排除掉！”
小智道：“我想你误会了！我们并不是坏人！”
红色的盖诺赛克特有些生气道：“动手！”
空中的两只盖诺赛克特同时使用了信号光束攻向了小智他们，小智身边的盖诺赛克特如同做错事一般，小智道：“不用担心，交给我了！达克莱伊，绕后使用精神强念！”
达克莱伊如鬼魅般的身影从小智的影子中钻出，下一瞬就出现在空中的两只盖诺赛克特身后，强大的精神力将它们两个限制住行动。神兽级宝可梦的威压完全释放，盖诺赛克特的实力堪比神兽级但总归比起真正的神兽还是要稍逊一筹。
盖诺赛克特请求道：“放过......”
小智道：“放开吧，达克莱伊。”
红色的盖诺赛克特看了一眼站在小智身边的达克莱伊下达了离开的命令。小智身边的盖诺塞克特道：“谢谢！”说完之后也跟着红色的盖诺赛克特变成飞盘形态离开了。
盖诺赛克特们离开之后，天边一道白色的能量光柱冲到了小智的面前停下，是超梦的超级进化Y的形态，它变为了普通的样子对小智道：“好久不见！”
小智微笑着拿出了超梦的精灵球，这只超梦不是来找他的，而是来找他的超梦的。
小智的超梦道：“好久不见！小智，它是与我同一时间实验制造出来的超梦，它体内的梦幻基因不稳定所以被火箭队放弃了，在那座研究所爆炸的时候我断后让它先离开了。”
小智道：“原来如此！”
超梦道：“其实我是追着盖诺赛克特来到这里的，它们被人类复活又进行了改造跟我们的遭遇很相似，所以我想要帮助它们。”
小智的超梦道：“这样的话算我一份。”